1877(明治10)年２月、八重(綾瀬はるか)は襄(オダギリジョー)と共に、新築された同志社英学校の校舎で備品の準備に追われていた。

そのころ鹿児島では、西郷隆盛(吉川晃司)が配下の不平士族らの決起を止められずに挙兵。

「西南戦争」の幕が切って落とされる。

政府軍に仕官した山川浩(玉山鉄二)や、警視庁の佐川官兵衛(中村獅童)や藤田五郎(＝斎藤一・降谷建志)も参戦。

激戦地・田原坂で進退窮まった政府軍の大山巌(反町隆史)は、官兵衛と藤田を抜刀隊に選抜し、従兄弟である西郷に戦いを挑む。

きりしま悠久の宿　一心

小島楓（松嶋菜々子）たちは救命救急センターに来た途端、吐血して倒れた患者の処置にあたった。

桜庭睦子（安寿ミラ）は、患者の血液を浴びてしまった国友花音（波瑠）に寄り添い執拗な洗浄を促す。花音はセンターの仮眠室で様子をみることになった。

　吐血患者がアフリカから帰国したばかりのフリーカメラマン兵頭明佳（小椋毅）と判明。

医局員たちに緊張が走る。楓の報告に最上透（段田安則）も花音の様子を気にかけていた。

感染症センターの為我井智（やべけんじ）が兵頭の血液検査の結果を持って来る。
感染予防のマスクを着用した為我井が示したのは１類感染症（感染した場合、極めて重篤な状態になりうる）マールブルク病を引き起こすウィルスだった。

そこに飛び込んできた美木麻衣子（岡本玲）が、兵頭の容態急変を告げる。

兵頭は亡くなった…。

翌朝、院長執務室では、為我井と今後の相談がなされる。

通常通りの勤務を求める楓に為我井は反対しない。

しかし、杉吉康弘センター長（手塚とおる）は救命センターの一時隔離を主張。

最上がそれを認めた。

花音は発症してICUの個室に移される。

数日後、空気感染の恐れはないため、救命センターの隔離が解かれた。

だが、その矢先、マールブルク病の症状に似た患者が次々と運ばれて来る。かつてない異常事態が、楓と医局員たちを襲う。

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両親の理解を得られた昇は、長島家から出て行ってしまうのか？

さらに、今まで姿を現すことが無かった恵理の夫・正夫（岡田義徳）が誠の前に現れる。

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